Shinji Ikari
Shinji è il figlio di Gendo, ha passato la maggior parte della sua vita con i suoi nonni (ed. manga) zii (ed. anime).
Ha conosciuto poco sua madre Yui Ikari, tanto meno suo padre,con cui malgrado essere il parente più stretto non ha con quest' ultimo un buon rapporto. Shinji è il pilota dell' unità Eva-01,è lui che ha spesso missioni più difficili,dovuto al fatto che la sincronia tra lui e il robot e semplicemente perfetta,è sicuramente il più indicato per gli attacchi corpo a corpo,durante lo svolgersi della storia si troverà più volte in situazioni al limite dell'umano,al limite di quello che chiamiamo "conscio",infatti Shinji si troverà in situazioni di cui neanche lui saprà come c'è l'abbia fatta,come se l'Eva autonomamente abbia trovato le forze giuste per sconfiggere il nemico.

Rei Ayanami
Ragazzina timida e riservata, sembra essere a suo agio sono in compagnia del comandante Gendo Ikari, il quale dimostra aver più importanza per lei che per Shinji.
Rei vive in un appartamento in periferia privo di quei elementi che vi sono all'interno di una stanza femminile, infatti le sole cose che possono notarsi sono un letto, delle sedie ed altri piccoli mobili, il tutto dentro una stanza grigia che oltre ad essere piena di sporcizia dovunque,vi sono presenti anche fascie da ospedale sporche di sangue.La vita di Rei non sembra essere molto felice,inoltre è incapace di mostrare alcuni comportamenti normali degli esseri umani,quale il sorriso…..l'amore e l'amicizia.
 

Asuka Soryu Langley
Estroversa ed esuberante la nostra "Second Children" viene mandata dalla Germania, ove si trova la 2° divisione della NERV, in compagnia di Kaji, suo responsabile nonché bell'uomo, il quale attira l'attenzione della ragazza,la quale si dimostra essere disposta a donargli il proprio corpo. Kaji ritiene quest' ultima ancora una bambina, mostrandosi disinteressato a lei e di nuovo abbagliato dalla  bellezza della Signorina Misato. Asuka vive un'infanzia molto problematica,in quanto affronta la morte delle madre,e la difficile vita che segue che la vedrà sempre sola,si spiega così il carattere "peperino",ma allo stesso tempo problematico della Second Children.
Asuka pilota l'unità Eva-02,la prima ad essere progettata allo scontro corpo a corpo contro gli Angeli. L'invidia e la rabbia di Asuka crescono di episodio in episodio,a causa della perfetta sincronia che Shinji ha con la sua unità e dal perfetto modo con cui Shinji affronta i suoi nemici. 

Gendo Ikari
Padre di Shiniji e Direttore Supremo della Nerv, il suo nome prima del matrimonio era Gendo Rokubungi, Dopo la morte di Yui, impegno se stesso nel "Progetto Adam" e nel "Progetto per il perfezionamento dell'uomo". Ottenne il supporto dalla Seele e grazie agli enormi contributi finanziari costruì gli Eva.
Gli unici sorrisi e manifestazioni di gentilezza li ha con la "First Children" Rei Ayanami, la quale ricambia l'affetto ricevuto, anche se la causa sembra essere sconosciuta.
  

Yui Ikari
Madre di Shinji,la scienziata in giovane età entra a far parte di una segreta società chiamata Seele,il suo scopo è quello di costruire le macchine umanoidi chiamati Eva.Durante l'attivazione di quest ultime perde la vita per un incidente.Il marito Gendo dà in affidamento Shinji,intanto prende il controllo della Nerv,la quale nasce qualche anno più tardi ma rimane comunque sotto la dipendenza della Seele.Yui Gendo e Kozo formavano un'equipe di ricercatori e scienziati cheavrebbe portato la Nerv a sviluppare ben due unità completamente funzionanti,quali l'Eva-00 e 01, solo successivamente lo 02.
Quando ancora non era avvenuto il "Second Impact",Yui e Gendo si fidanzano e infine si sposano,dando vita alle incertezze del Prof. Kozo Fuyustuki,a quel tempo professore all'università di Kyoto.
  

Misato Katsuragi
E' l'unica sopravvissuta al "Second Impact", suo padre famoso ricercatore era in Antartide dove tra lo svolgersi di ricerche si trova in una gigantesca esplosione che vede coinvolto lui e tutto il su reparto,mettendo però in salvo la piccola figlioletta Misato.
Misato vivrà anni di tristezza in cui per colpa di una malattia, non parlerà fino all'età adulta in cui una volta arrivata all'università farà la conoscenza dell'amica Ritsuko e del suo grande amore Ryoji, con il quale passera i migliori anni della sua vita, i due infine si lasciarono, dando così vita a problemi sentimentali che si susseguono nel corso della serie.
Misato,esuberante e simpatica convive a casa con Shinji e con grazioso pinguino di nome PenPen,il quale vive all'interno di un grande frigorifero provvisto di qualche piccola comodità.
E' una amante delle auto sportive ed è una grande bevitrice di birra,né ha la casa piena e come se non bastasse è piuttosto disordinata,solo dopo l'arrivo di Shinji,la casa ritorna ad essere vivibile e luogo di riflessione non solo da parte di Misato ma anche di Shinji.

Ryoji Kaji
Fa parte del Dipartimento di Sorveglianza speciale dell'agenzia segreta Nerv, fa anche parte del Dipartimento Investigativo del Ministero Interno del governo del Giappone. Prende ordini dalla Seele, si infiltra nella Nerv per scoprirne i segreti. Misato e lui formavano una bella coppia ai tempi dell'università che venne però interrotta col tempo e che venne però ripresa in Giappone nel 2015, anno in cui Kaji torna dalla Germania in compagnia della "Second Childre" Asuka,quest ultima prova un enorme affetto per Kaji che però non è corrisposto a causa della ancora tenera età di Asuka.

Naoto Akagi
E' stata la più importante scienziata agli esordi della Nerv, quando ancora la figlia Ritsuko, studiava lei dirigeva già i primi reparti operativi della Nerv, celando però un storia sentimentale con il comandante supremo Gendo Ikari. E' la creatrice del fantastico computer sito all'interno della Nerv, il MAGI, il quale oltre a prendere banali decisioni su Neo-Tokyo 3, prende inoltre importanti decisioni su come sferrare gli attacchi contro gli Angeli e sul modo in cui comportarsi in caso di pericolo.
I tre computer sono:MELCHIOR-1, BALTHASAR-2 e CASPER-3 (Melchiorre Beltazorre e Gasparre)possiedono le modalità di pensiero di Naoko rispettivamente come scienziata, madre e donna.

Hikari Horaki
E' la capoclasse di Shinji, è amica di Asuka e nutre amore per Toji Suzuhara, anche se lui non sembra esserne interessato. E' inoltre brava nel cucinare graziosi e gustosi manicaretti che prepara sempre per Toji, anche se non sempre lui li mangia.

Toji Suzuhara
Compagno e amico di Shinji, nei primi episodi si mostra violento e scorbutico nei confronti di Shinji, il quale nel suo primo combattimento contro Sachiel, provoca il ferimento della sorella minore di Toji.
I due una volta riappacificati diventano amici inseparabili grazie anche alla Sign. Misato che attira l'attenzione del giovane ragazzo.
E' il quarto soggetto classificato dal "Rapporto Marduk" per pilotare l'unità Eva-03,ma durante la sua prima attivazione,un Angelo sembra essersi impossessato del robot che si vedrà costretto a combattere proprio contro Shinji.
Nell'edizione manga,Toji muore proprio per mano dell'Eva pilotato da Shinji,anche se il vero pilota era un "Dummy Sistem",ovvero un pilota di riserva che può essere attivato in qualsiasi momento.
Nell' anime invece Toji perde una gamba e un braccio e sarà proprio la capoclasse Hikari,ad andarlo a trovare per constatare la sua salute.
Grande amico di Toji è Kensuke,amici fin da piccoli né hanno passate di tutti i colori.

Kensuke Aida
Amico e compagno di Shinji, ha una grande passione per la video-camera con cui riprende tutti gli avvenimenti più importanti che avvengono a Neo-Tokyo 3, quali i combattimenti contro gli Angeli che vedono proprio Shinji, protagonista dell'evento.
Prova anche lui notevoli attenzioni sulla Sign. Misato ed inoltre gioca a fare il militare,vestito solo di elmetto e fucile (ovviamente finto),ed interpreta tutti i ruoli da quello dell'uomo morente a quello del soldato coraggioso di nome Aida…..eheheheheh,un tipo simpatico e calmo con cui Shinji troverà uno splendido feeling.

Maya Ibuki
Secondo luogotenente. Appartiene alla prima sezione del Bureau of Tecnology nel quartier generale della Nerv, è responsabile di compiti come il monitoraggio del Livello di Sincronia dei piloti degli Eva e l'analisi di tutti i dati riguardanti gli Eva. Ha molto rispetto della Dr.Akagi Ritsuko, suo immediato superiore, chiamando quest'ultima "sempai". Sembra essere una ragazza allegra e simpatica,che sorride alla vita,ma durante la serie sono pochissime le volte che la vediamo fuori dalle vesti di luogotenente. 
  

Shingero Aoba
Il suo grado è Luogotenente. Le sue responsabilità includono comunicazioni e analisi dei dati.
Il suo hobby è la chitarra che suona però solo in rare occasioni in compagnia dei suoi colleghi più cari. Ragazzo di bell' aspetto,porta i capelli lunghi e veste sportiva dopo il lavoro.

Makoto Hyuga
Luogotenente, appartiene alla prima sezione del Bureau of combat Operation del Dipartimento centrale di comando per le operazioni di combattimento della Nerv. Agisce come "aiuto sul campo" per Misato, capo delle operazioni di combattimento, ed è anche responsabile per operazioni come l'analisi delle situazioni di combattimento. Ha un buon rapporto con Misato, suo superiore, dandole molte volte una mano per vari scopi e raccogliendo informazioni riservate in molte occasioni,dando però meno spazio ai suoi veri sentimenti che prova per lei,forse anche per una sua eccessiva timidezza.